Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Amigo1Q80ZD8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Amigo1Q80ZD8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Amigo1Q80ZD8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Amigo1Q80ZD8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Amigo1Q80ZD8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Amigo1Q80ZD8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Amigo1Q80ZD8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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