Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rpp38Q80UU2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rpp38Q80UU2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rpp38Q80UU2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rpp38Q80UU2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rpp38Q80UU2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rpp38Q80UU2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rpp38Q80UU2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rpp38Q80UU2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rpp38Q80UU2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rpp38Q80UU2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rpp38Q80UU2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rpp38Q80UU2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpp38Q80UU2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpp38Q80UU2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpp38Q80UU2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpp38Q80UU2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpp38Q80UU2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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