Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
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