Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms