Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms