Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trim37Q6PCX9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trim37Q6PCX9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trim37Q6PCX9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trim37Q6PCX9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim37Q6PCX9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim37Q6PCX9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim37Q6PCX9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim37Q6PCX9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Trim37Q6PCX9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Trim37Q6PCX9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Trim37Q6PCX9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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