Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp12Q6P5B0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp12Q6P5B0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms