Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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