Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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