Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms