Protein–RNA interactions for Protein: Q64364

Cdkn2a, Tumor suppressor ARF, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2aQ64364 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkn2aQ64364 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkn2aQ64364 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkn2aQ64364 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkn2aQ64364 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkn2aQ64364 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkn2aQ64364 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkn2aQ64364 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkn2aQ64364 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkn2aQ64364 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkn2aQ64364 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkn2aQ64364 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkn2aQ64364 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkn2aQ64364 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkn2aQ64364 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkn2aQ64364 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkn2aQ64364 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkn2aQ64364 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkn2aQ64364 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkn2aQ64364 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkn2aQ64364 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkn2aQ64364 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkn2aQ64364 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkn2aQ64364 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkn2aQ64364 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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