Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TrhQ62361 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrhQ62361 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TrhQ62361 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrhQ62361 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms