Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms