Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms