Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HellsQ60848 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HellsQ60848 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HellsQ60848 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
HellsQ60848 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HellsQ60848 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HellsQ60848 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HellsQ60848 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HellsQ60848 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HellsQ60848 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HellsQ60848 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HellsQ60848 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HellsQ60848 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HellsQ60848 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HellsQ60848 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HellsQ60848 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HellsQ60848 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HellsQ60848 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HellsQ60848 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HellsQ60848 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms