Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ggnbp2Q5SV77 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ggnbp2Q5SV77 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ggnbp2Q5SV77 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ggnbp2Q5SV77 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ggnbp2Q5SV77 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ggnbp2Q5SV77 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ggnbp2Q5SV77 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ggnbp2Q5SV77 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ggnbp2Q5SV77 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ggnbp2Q5SV77 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ggnbp2Q5SV77 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ggnbp2Q5SV77 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ggnbp2Q5SV77 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ggnbp2Q5SV77 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ggnbp2Q5SV77 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ggnbp2Q5SV77 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggnbp2Q5SV77 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggnbp2Q5SV77 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggnbp2Q5SV77 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggnbp2Q5SV77 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggnbp2Q5SV77 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggnbp2Q5SV77 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggnbp2Q5SV77 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggnbp2Q5SV77 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggnbp2Q5SV77 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggnbp2Q5SV77 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms