Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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Trim58Q5NCC9 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Trim58Q5NCC9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Trim58Q5NCC9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Trim58Q5NCC9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Trim58Q5NCC9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms