Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms