Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms