Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BB287469Q3UT53 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms