Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Hdgfl2Q3UMU9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hdgfl2Q3UMU9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hdgfl2Q3UMU9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hdgfl2Q3UMU9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms