Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BtrcQ3ULA2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BtrcQ3ULA2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms