Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms