Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hddc2Q3SXD3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
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