Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb38Q3LR78 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms