Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms