Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms