Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms