Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb5Q02739 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms