Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms