Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms