Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms