Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms