Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhodP97348 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhodP97348 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhodP97348 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhodP97348 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhodP97348 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhodP97348 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhodP97348 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhodP97348 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhodP97348 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhodP97348 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhodP97348 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhodP97348 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhodP97348 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhodP97348 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhodP97348 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhodP97348 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhodP97348 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhodP97348 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhodP97348 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhodP97348 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhodP97348 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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