Protein–RNA interactions for Protein: P86449

Trim43c, Tripartite motif-containing protein 43C, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43cP86449 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Trim43cP86449 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Trim43cP86449 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Trim43cP86449 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Trim43cP86449 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Trim43cP86449 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Trim43cP86449 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43cP86449 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43cP86449 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43cP86449 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43cP86449 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43cP86449 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43cP86449 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43cP86449 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43cP86449 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43cP86449 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43cP86449 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43cP86449 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43cP86449 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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