Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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