Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf5P70191 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms