Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Snrpd1P62315 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Snrpd1P62315 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Snrpd1P62315 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Snrpd1P62315 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Snrpd1P62315 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Snrpd1P62315 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Snrpd1P62315 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Snrpd1P62315 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Snrpd1P62315 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Snrpd1P62315 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Snrpd1P62315 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Snrpd1P62315 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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