Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms