Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms