Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Defb1P56386 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms