Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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