Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XpcP51612 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XpcP51612 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XpcP51612 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XpcP51612 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XpcP51612 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XpcP51612 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XpcP51612 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XpcP51612 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XpcP51612 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XpcP51612 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XpcP51612 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XpcP51612 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XpcP51612 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XpcP51612 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XpcP51612 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XpcP51612 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XpcP51612 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XpcP51612 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XpcP51612 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XpcP51612 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XpcP51612 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XpcP51612 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XpcP51612 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XpcP51612 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XpcP51612 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XpcP51612 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XpcP51612 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XpcP51612 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XpcP51612 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XpcP51612 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XpcP51612 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XpcP51612 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XpcP51612 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XpcP51612 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XpcP51612 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XpcP51612 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XpcP51612 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XpcP51612 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
XpcP51612 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XpcP51612 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XpcP51612 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XpcP51612 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XpcP51612 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XpcP51612 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XpcP51612 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XpcP51612 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
XpcP51612 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XpcP51612 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XpcP51612 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XpcP51612 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XpcP51612 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XpcP51612 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XpcP51612 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XpcP51612 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XpcP51612 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XpcP51612 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XpcP51612 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XpcP51612 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XpcP51612 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XpcP51612 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XpcP51612 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms