Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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