Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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