Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms