Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms