Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.2 ms