Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik2P39087 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik2P39087 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms