Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpardP35396 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpardP35396 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpardP35396 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpardP35396 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpardP35396 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpardP35396 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpardP35396 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PpardP35396 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpardP35396 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpardP35396 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpardP35396 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PpardP35396 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpardP35396 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpardP35396 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpardP35396 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpardP35396 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PpardP35396 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PpardP35396 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PpardP35396 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PpardP35396 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpardP35396 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms